Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Kdm5cP41230 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
Kdm5cP41230 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
Kdm5cP41230 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Kdm5cP41230 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Kdm5cP41230 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
Kdm5cP41230 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Kdm5cP41230 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
Kdm5cP41230 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
Kdm5cP41230 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Kdm5cP41230 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Kdm5cP41230 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
Kdm5cP41230 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Kdm5cP41230 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
Kdm5cP41230 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.69■■■■□ 3.62
Kdm5cP41230 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
Kdm5cP41230 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Kdm5cP41230 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
Kdm5cP41230 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
Kdm5cP41230 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC37.57■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Kdm5cP41230 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC37.51■■■■□ 3.59
Kdm5cP41230 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Kdm5cP41230 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Kdm5cP41230 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Kdm5cP41230 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Kdm5cP41230 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Kdm5cP41230 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Kdm5cP41230 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Kdm5cP41230 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Kdm5cP41230 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
Kdm5cP41230 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Kdm5cP41230 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Kdm5cP41230 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Kdm5cP41230 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Kdm5cP41230 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Kdm5cP41230 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Kdm5cP41230 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Kdm5cP41230 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Kdm5cP41230 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
Kdm5cP41230 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
Kdm5cP41230 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Kdm5cP41230 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Kdm5cP41230 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Kdm5cP41230 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Kdm5cP41230 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Kdm5cP41230 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Kdm5cP41230 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Kdm5cP41230 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Kdm5cP41230 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Kdm5cP41230 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Kdm5cP41230 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Kdm5cP41230 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.54
Kdm5cP41230 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Kdm5cP41230 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Kdm5cP41230 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Kdm5cP41230 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC37.12■■■■□ 3.53
Kdm5cP41230 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC37.11■■■■□ 3.53
Kdm5cP41230 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
Kdm5cP41230 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Kdm5cP41230 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC37.07■■■■□ 3.53
Kdm5cP41230 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Kdm5cP41230 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Kdm5cP41230 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC37.06■■■■□ 3.52
Kdm5cP41230 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Kdm5cP41230 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Kdm5cP41230 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
Kdm5cP41230 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Kdm5cP41230 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms