Protein–RNA interactions for Protein: P37913

Lig1, DNA ligase 1, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lig1P37913 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Lig1P37913 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Lig1P37913 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lig1P37913 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Lig1P37913 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Lig1P37913 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Lig1P37913 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lig1P37913 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Lig1P37913 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Lig1P37913 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Lig1P37913 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lig1P37913 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lig1P37913 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Lig1P37913 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Lig1P37913 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Lig1P37913 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Lig1P37913 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lig1P37913 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Lig1P37913 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Lig1P37913 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Lig1P37913 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Lig1P37913 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lig1P37913 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lig1P37913 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lig1P37913 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Lig1P37913 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lig1P37913 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Lig1P37913 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Lig1P37913 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lig1P37913 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lig1P37913 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Lig1P37913 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lig1P37913 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Lig1P37913 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Lig1P37913 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Lig1P37913 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lig1P37913 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lig1P37913 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lig1P37913 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lig1P37913 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lig1P37913 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Lig1P37913 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lig1P37913 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lig1P37913 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lig1P37913 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lig1P37913 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Lig1P37913 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lig1P37913 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lig1P37913 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lig1P37913 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lig1P37913 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lig1P37913 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lig1P37913 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lig1P37913 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lig1P37913 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lig1P37913 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lig1P37913 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lig1P37913 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lig1P37913 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lig1P37913 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lig1P37913 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lig1P37913 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lig1P37913 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lig1P37913 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lig1P37913 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Lig1P37913 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lig1P37913 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lig1P37913 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lig1P37913 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lig1P37913 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lig1P37913 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lig1P37913 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lig1P37913 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lig1P37913 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lig1P37913 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Lig1P37913 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lig1P37913 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lig1P37913 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lig1P37913 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lig1P37913 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lig1P37913 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lig1P37913 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lig1P37913 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lig1P37913 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lig1P37913 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lig1P37913 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lig1P37913 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lig1P37913 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lig1P37913 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Lig1P37913 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lig1P37913 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Lig1P37913 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lig1P37913 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lig1P37913 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lig1P37913 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lig1P37913 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lig1P37913 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lig1P37913 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lig1P37913 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Lig1P37913 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms