Protein–RNA interactions for Protein: P32048

MSK1, Lysine--tRNA ligase, mitochondrial, yeastyeast

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
MSK1P32048 TRT2tT(CGU)K 72 nt7.81□□□□□ -1.16
MSK1P32048 SHB17YKR043C 816 nt7.81□□□□□ -1.16
MSK1P32048 YKL133CYKL133C 1392 nt7.81□□□□□ -1.16
MSK1P32048 THI72YOR192C 1800 nt7.8□□□□□ -1.16
MSK1P32048 YPL251WYPL251W 303 nt7.8□□□□□ -1.16
MSK1P32048 HXT10YFL011W 1641 nt7.8□□□□□ -1.16
MSK1P32048 RFC1YOR217W 2586 nt7.78□□□□□ -1.16
MSK1P32048 YPS3YLR121C 1527 nt7.78□□□□□ -1.16
MSK1P32048 MEP3YPR138C 1470 nt7.77□□□□□ -1.17
MSK1P32048 PEX2YJL210W 816 nt7.77□□□□□ -1.17
MSK1P32048 CWP2YKL096W-A 279 nt7.76□□□□□ -1.17
MSK1P32048 SBA1YKL117W 651 nt7.76□□□□□ -1.17
MSK1P32048 PAU7YAR020C 168 nt7.76□□□□□ -1.17
MSK1P32048 YDR010CYDR010C 333 nt7.75□□□□□ -1.17
MSK1P32048 PHO23YNL097C 993 nt7.75□□□□□ -1.17
MSK1P32048 FLR1YBR008C 1647 nt7.74□□□□□ -1.17
MSK1P32048 HIP1YGR191W 1812 nt7.74□□□□□ -1.17
MSK1P32048 SAM2YDR502C 1155 nt7.74□□□□□ -1.17
MSK1P32048 YHR219WYHR219W 1875 nt7.74□□□□□ -1.17
MSK1P32048 MET28YIR017C 564 nt7.73□□□□□ -1.17
MSK1P32048 HEM14YER014W 1620 nt7.73□□□□□ -1.17
MSK1P32048 AKR2YOR034C 2250 nt7.73□□□□□ -1.17
MSK1P32048 YFL066CYFL066C 1179 nt7.72□□□□□ -1.17
MSK1P32048 ALP1YNL270C 1722 nt7.72□□□□□ -1.17
MSK1P32048 NBA1YOL070C 1506 nt7.71□□□□□ -1.18
MSK1P32048 DLD2YDL178W 1593 nt7.71□□□□□ -1.18
MSK1P32048 YMR103CYMR103C 363 nt7.7□□□□□ -1.18
MSK1P32048 LSR1LSR1 1175 nt7.7□□□□□ -1.18
MSK1P32048 MEX67YPL169C 1800 nt7.7□□□□□ -1.18
MSK1P32048 TIM44YIL022W 1296 nt7.69□□□□□ -1.18
MSK1P32048 TOK1YJL093C 2076 nt7.69□□□□□ -1.18
MSK1P32048 AGP3YFL055W 1677 nt7.68□□□□□ -1.18
MSK1P32048 OXA1YER154W 1209 nt7.68□□□□□ -1.18
MSK1P32048 HUA1YGR268C 597 nt7.68□□□□□ -1.18
MSK1P32048 SEC61YLR378C 1443 nt7.68□□□□□ -1.18
MSK1P32048 RPD3YNL330C 1302 nt7.66□□□□□ -1.18
MSK1P32048 HEM13YDR044W 987 nt7.65□□□□□ -1.18
MSK1P32048 RSC4YKR008W 1878 nt7.64□□□□□ -1.19
MSK1P32048 NRT1YOR071C 1797 nt7.64□□□□□ -1.19
MSK1P32048 DLD3YEL071W 1491 nt7.63□□□□□ -1.19
MSK1P32048 YDR306CYDR306C 1437 nt7.63□□□□□ -1.19
MSK1P32048 YMR262WYMR262W 942 nt7.63□□□□□ -1.19
MSK1P32048 FIT3YOR383C 615 nt7.63□□□□□ -1.19
MSK1P32048 UTH1YKR042W 1098 nt7.62□□□□□ -1.19
MSK1P32048 Q0010Q0010 387 nt7.62□□□□□ -1.19
MSK1P32048 MDL2YPL270W 2322 nt7.62□□□□□ -1.19
MSK1P32048 PHO89YBR296C 1725 nt7.61□□□□□ -1.19
MSK1P32048 YLR046CYLR046C 813 nt7.6□□□□□ -1.19
MSK1P32048 AIM1YAL046C 357 nt7.59□□□□□ -1.19
MSK1P32048 MRPL8YJL063C 717 nt7.58□□□□□ -1.2
MSK1P32048 ENT4YLL038C 744 nt7.58□□□□□ -1.2
MSK1P32048 INH1YDL181W 258 nt7.57□□□□□ -1.2
MSK1P32048 YER188WYER188W 720 nt7.57□□□□□ -1.2
MSK1P32048 COQ2YNR041C 1119 nt7.57□□□□□ -1.2
MSK1P32048 MIM1YOL026C 342 nt7.57□□□□□ -1.2
MSK1P32048 MTO1YGL236C 2010 nt7.57□□□□□ -1.2
MSK1P32048 MSF1YPR047W 1410 nt7.56□□□□□ -1.2
MSK1P32048 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.56□□□□□ -1.2
MSK1P32048 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.56□□□□□ -1.2
MSK1P32048 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.56□□□□□ -1.2
MSK1P32048 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.56□□□□□ -1.2
MSK1P32048 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.56□□□□□ -1.2
MSK1P32048 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.56□□□□□ -1.2
MSK1P32048 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.56□□□□□ -1.2
MSK1P32048 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.56□□□□□ -1.2
MSK1P32048 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.56□□□□□ -1.2
MSK1P32048 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.56□□□□□ -1.2
MSK1P32048 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.56□□□□□ -1.2
MSK1P32048 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.56□□□□□ -1.2
MSK1P32048 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.56□□□□□ -1.2
MSK1P32048 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.56□□□□□ -1.2
MSK1P32048 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.56□□□□□ -1.2
MSK1P32048 RIM2YBR192W 1134 nt7.56□□□□□ -1.2
MSK1P32048 KRR1YCL059C 951 nt7.55□□□□□ -1.2
MSK1P32048 RPC31YNL151C 756 nt7.55□□□□□ -1.2
MSK1P32048 OSH7YHR001W 1314 nt7.54□□□□□ -1.2
MSK1P32048 CLB6YGR109C 1143 nt7.54□□□□□ -1.2
MSK1P32048 FUB1YCR076C 753 nt7.53□□□□□ -1.2
MSK1P32048 VMA11YPL234C 495 nt7.53□□□□□ -1.2
MSK1P32048 DAK2YFL053W 1776 nt7.53□□□□□ -1.2
MSK1P32048 UBA4YHR111W 1323 nt7.52□□□□□ -1.2
MSK1P32048 HBS1YKR084C 1836 nt7.52□□□□□ -1.2
MSK1P32048 YFR018CYFR018C 1092 nt7.52□□□□□ -1.21
MSK1P32048 ITR2YOL103W 1830 nt7.52□□□□□ -1.21
MSK1P32048 BNI5YNL166C 1347 nt7.52□□□□□ -1.21
MSK1P32048 MSC1YML128C 1542 nt7.51□□□□□ -1.21
MSK1P32048 DPL1YDR294C 1770 nt7.51□□□□□ -1.21
MSK1P32048 TIP1YBR067C 633 nt7.5□□□□□ -1.21
MSK1P32048 PUS7YOR243C 2031 nt7.5□□□□□ -1.21
MSK1P32048 FET5YFL041W 1869 nt7.49□□□□□ -1.21
MSK1P32048 RPL4BYDR012W 1089 nt7.49□□□□□ -1.21
MSK1P32048 RPL4AYBR031W 1089 nt7.49□□□□□ -1.21
MSK1P32048 LEU4YNL104C 1860 nt7.49□□□□□ -1.21
MSK1P32048 TAT2YOL020W 1779 nt7.48□□□□□ -1.21
MSK1P32048 UFD1YGR048W 1086 nt7.48□□□□□ -1.21
MSK1P32048 YJR154WYJR154W 1041 nt7.48□□□□□ -1.21
MSK1P32048 YCR087WYCR087W 516 nt7.47□□□□□ -1.21
MSK1P32048 LSM5YER146W 282 nt7.47□□□□□ -1.21
MSK1P32048 MIR1YJR077C 936 nt7.47□□□□□ -1.21
MSK1P32048 ASP3-1YLR155C 1089 nt7.47□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 42.1 ms