Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RxrgP28705 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RxrgP28705 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RxrgP28705 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RxrgP28705 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RxrgP28705 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RxrgP28705 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RxrgP28705 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RxrgP28705 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
RxrgP28705 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RxrgP28705 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RxrgP28705 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RxrgP28705 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RxrgP28705 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RxrgP28705 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RxrgP28705 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RxrgP28705 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RxrgP28705 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RxrgP28705 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RxrgP28705 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RxrgP28705 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RxrgP28705 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RxrgP28705 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RxrgP28705 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RxrgP28705 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RxrgP28705 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RxrgP28705 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RxrgP28705 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RxrgP28705 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RxrgP28705 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RxrgP28705 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RxrgP28705 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RxrgP28705 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RxrgP28705 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RxrgP28705 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RxrgP28705 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RxrgP28705 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RxrgP28705 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
RxrgP28705 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RxrgP28705 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RxrgP28705 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RxrgP28705 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RxrgP28705 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RxrgP28705 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RxrgP28705 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RxrgP28705 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RxrgP28705 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RxrgP28705 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RxrgP28705 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RxrgP28705 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RxrgP28705 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RxrgP28705 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RxrgP28705 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
RxrgP28705 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
RxrgP28705 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RxrgP28705 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RxrgP28705 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RxrgP28705 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
RxrgP28705 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RxrgP28705 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RxrgP28705 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
RxrgP28705 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
RxrgP28705 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RxrgP28705 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RxrgP28705 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RxrgP28705 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RxrgP28705 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RxrgP28705 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RxrgP28705 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RxrgP28705 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RxrgP28705 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RxrgP28705 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RxrgP28705 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RxrgP28705 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RxrgP28705 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RxrgP28705 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RxrgP28705 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
RxrgP28705 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RxrgP28705 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RxrgP28705 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RxrgP28705 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RxrgP28705 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RxrgP28705 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RxrgP28705 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RxrgP28705 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RxrgP28705 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RxrgP28705 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RxrgP28705 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RxrgP28705 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RxrgP28705 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RxrgP28705 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RxrgP28705 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RxrgP28705 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RxrgP28705 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RxrgP28705 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RxrgP28705 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RxrgP28705 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RxrgP28705 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RxrgP28705 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RxrgP28705 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms