Protein–RNA interactions for Protein: P27681

Gabrg3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrg3P27681 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gabrg3P27681 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gabrg3P27681 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gabrg3P27681 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gabrg3P27681 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gabrg3P27681 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gabrg3P27681 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Gabrg3P27681 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gabrg3P27681 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gabrg3P27681 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gabrg3P27681 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gabrg3P27681 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gabrg3P27681 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gabrg3P27681 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gabrg3P27681 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gabrg3P27681 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabrg3P27681 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gabrg3P27681 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gabrg3P27681 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gabrg3P27681 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gabrg3P27681 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gabrg3P27681 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gabrg3P27681 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabrg3P27681 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gabrg3P27681 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gabrg3P27681 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gabrg3P27681 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gabrg3P27681 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gabrg3P27681 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gabrg3P27681 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gabrg3P27681 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gabrg3P27681 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gabrg3P27681 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Gabrg3P27681 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gabrg3P27681 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabrg3P27681 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabrg3P27681 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gabrg3P27681 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabrg3P27681 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gabrg3P27681 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gabrg3P27681 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Gabrg3P27681 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabrg3P27681 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gabrg3P27681 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gabrg3P27681 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gabrg3P27681 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gabrg3P27681 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gabrg3P27681 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gabrg3P27681 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gabrg3P27681 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabrg3P27681 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gabrg3P27681 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gabrg3P27681 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gabrg3P27681 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gabrg3P27681 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gabrg3P27681 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gabrg3P27681 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gabrg3P27681 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabrg3P27681 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Gabrg3P27681 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gabrg3P27681 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gabrg3P27681 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Gabrg3P27681 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabrg3P27681 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabrg3P27681 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Gabrg3P27681 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gabrg3P27681 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabrg3P27681 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabrg3P27681 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Gabrg3P27681 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabrg3P27681 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gabrg3P27681 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabrg3P27681 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabrg3P27681 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gabrg3P27681 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabrg3P27681 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabrg3P27681 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gabrg3P27681 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gabrg3P27681 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gabrg3P27681 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Gabrg3P27681 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Gabrg3P27681 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabrg3P27681 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabrg3P27681 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gabrg3P27681 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gabrg3P27681 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Gabrg3P27681 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabrg3P27681 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabrg3P27681 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gabrg3P27681 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabrg3P27681 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Gabrg3P27681 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabrg3P27681 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabrg3P27681 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gabrg3P27681 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gabrg3P27681 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabrg3P27681 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabrg3P27681 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabrg3P27681 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gabrg3P27681 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms