Protein–RNA interactions for Protein: P23242

Gja1, Gap junction alpha-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja1P23242 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gja1P23242 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Gja1P23242 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gja1P23242 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Gja1P23242 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Gja1P23242 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Gja1P23242 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Gja1P23242 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gja1P23242 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Gja1P23242 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja1P23242 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja1P23242 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja1P23242 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Gja1P23242 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gja1P23242 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Gja1P23242 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gja1P23242 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gja1P23242 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gja1P23242 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gja1P23242 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Gja1P23242 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gja1P23242 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Gja1P23242 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Gja1P23242 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gja1P23242 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gja1P23242 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Gja1P23242 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gja1P23242 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Gja1P23242 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Gja1P23242 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Gja1P23242 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gja1P23242 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gja1P23242 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Gja1P23242 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Gja1P23242 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Gja1P23242 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Gja1P23242 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Gja1P23242 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Gja1P23242 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gja1P23242 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Gja1P23242 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gja1P23242 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Gja1P23242 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Gja1P23242 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gja1P23242 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Gja1P23242 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gja1P23242 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Gja1P23242 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Gja1P23242 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gja1P23242 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Gja1P23242 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gja1P23242 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gja1P23242 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gja1P23242 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Gja1P23242 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gja1P23242 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Gja1P23242 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gja1P23242 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Gja1P23242 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Gja1P23242 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gja1P23242 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gja1P23242 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Gja1P23242 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gja1P23242 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gja1P23242 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gja1P23242 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gja1P23242 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gja1P23242 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja1P23242 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja1P23242 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja1P23242 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gja1P23242 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gja1P23242 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja1P23242 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gja1P23242 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gja1P23242 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gja1P23242 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gja1P23242 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gja1P23242 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gja1P23242 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gja1P23242 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gja1P23242 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gja1P23242 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gja1P23242 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gja1P23242 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Gja1P23242 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gja1P23242 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gja1P23242 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gja1P23242 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gja1P23242 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gja1P23242 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gja1P23242 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gja1P23242 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gja1P23242 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gja1P23242 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Gja1P23242 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gja1P23242 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gja1P23242 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gja1P23242 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gja1P23242 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms