Protein–RNA interactions for Protein: P16301

Lcat, Phosphatidylcholine-sterol acyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LcatP16301 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LcatP16301 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LcatP16301 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LcatP16301 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
LcatP16301 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
LcatP16301 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LcatP16301 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LcatP16301 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
LcatP16301 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
LcatP16301 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LcatP16301 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LcatP16301 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LcatP16301 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LcatP16301 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LcatP16301 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LcatP16301 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LcatP16301 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LcatP16301 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LcatP16301 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LcatP16301 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
LcatP16301 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LcatP16301 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LcatP16301 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LcatP16301 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LcatP16301 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LcatP16301 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LcatP16301 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LcatP16301 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LcatP16301 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LcatP16301 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LcatP16301 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LcatP16301 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LcatP16301 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LcatP16301 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LcatP16301 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LcatP16301 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LcatP16301 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LcatP16301 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LcatP16301 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LcatP16301 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LcatP16301 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LcatP16301 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LcatP16301 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LcatP16301 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
LcatP16301 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LcatP16301 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LcatP16301 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
LcatP16301 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LcatP16301 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
LcatP16301 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LcatP16301 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
LcatP16301 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LcatP16301 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LcatP16301 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
LcatP16301 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LcatP16301 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LcatP16301 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LcatP16301 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
LcatP16301 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
LcatP16301 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LcatP16301 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
LcatP16301 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LcatP16301 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LcatP16301 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
LcatP16301 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LcatP16301 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LcatP16301 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LcatP16301 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LcatP16301 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LcatP16301 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LcatP16301 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LcatP16301 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LcatP16301 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LcatP16301 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LcatP16301 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LcatP16301 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LcatP16301 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LcatP16301 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LcatP16301 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LcatP16301 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LcatP16301 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LcatP16301 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
LcatP16301 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LcatP16301 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LcatP16301 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LcatP16301 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LcatP16301 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LcatP16301 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LcatP16301 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LcatP16301 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LcatP16301 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LcatP16301 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LcatP16301 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LcatP16301 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LcatP16301 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LcatP16301 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LcatP16301 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LcatP16301 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LcatP16301 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LcatP16301 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms