Protein–RNA interactions for Protein: P10400

Pol, Retrovirus-related Pol polyprotein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP10400 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
PolP10400 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PolP10400 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PolP10400 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
PolP10400 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
PolP10400 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
PolP10400 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
PolP10400 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
PolP10400 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PolP10400 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
PolP10400 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP10400 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP10400 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP10400 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP10400 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
PolP10400 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP10400 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP10400 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP10400 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP10400 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP10400 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP10400 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP10400 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
PolP10400 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolP10400 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolP10400 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
PolP10400 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP10400 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
PolP10400 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
PolP10400 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
PolP10400 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolP10400 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
PolP10400 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP10400 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP10400 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP10400 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
PolP10400 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP10400 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP10400 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP10400 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP10400 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
PolP10400 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolP10400 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolP10400 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
PolP10400 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolP10400 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
PolP10400 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolP10400 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolP10400 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
PolP10400 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP10400 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP10400 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP10400 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
PolP10400 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PolP10400 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
PolP10400 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PolP10400 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PolP10400 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PolP10400 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PolP10400 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PolP10400 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PolP10400 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PolP10400 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PolP10400 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PolP10400 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PolP10400 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PolP10400 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolP10400 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PolP10400 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP10400 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP10400 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP10400 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PolP10400 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolP10400 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolP10400 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PolP10400 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP10400 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP10400 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP10400 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP10400 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP10400 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PolP10400 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP10400 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP10400 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PolP10400 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolP10400 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolP10400 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolP10400 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolP10400 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolP10400 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolP10400 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PolP10400 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PolP10400 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PolP10400 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PolP10400 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolP10400 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolP10400 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolP10400 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PolP10400 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PolP10400 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms