Protein–RNA interactions for Protein: P09633

Hoxc9, Homeobox protein Hox-C9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc9P09633 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33,38■■■□□ 2,93
Hoxc9P09633 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC33,38■■■□□ 2,93
Hoxc9P09633 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,38■■■□□ 2,93
Hoxc9P09633 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,36■■■□□ 2,93
Hoxc9P09633 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC33,35■■■□□ 2,93
Hoxc9P09633 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC33,34■■■□□ 2,93
Hoxc9P09633 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,34■■■□□ 2,93
Hoxc9P09633 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Hoxc9P09633 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
Hoxc9P09633 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Hoxc9P09633 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33,32■■■□□ 2,92
Hoxc9P09633 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC33,32■■■□□ 2,92
Hoxc9P09633 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33,3■■■□□ 2,92
Hoxc9P09633 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Hoxc9P09633 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC33,29■■■□□ 2,92
Hoxc9P09633 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,29■■■□□ 2,92
Hoxc9P09633 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC33,29■■■□□ 2,92
Hoxc9P09633 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Hoxc9P09633 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,28■■■□□ 2,92
Hoxc9P09633 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
Hoxc9P09633 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33,25■■■□□ 2,91
Hoxc9P09633 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
Hoxc9P09633 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,22■■■□□ 2,91
Hoxc9P09633 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC33,21■■■□□ 2,91
Hoxc9P09633 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Hoxc9P09633 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,19■■■□□ 2,9
Hoxc9P09633 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Hoxc9P09633 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Hoxc9P09633 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33,18■■■□□ 2,9
Hoxc9P09633 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,18■■■□□ 2,9
Hoxc9P09633 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Hoxc9P09633 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33,17■■■□□ 2,9
Hoxc9P09633 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC33,17■■■□□ 2,9
Hoxc9P09633 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
Hoxc9P09633 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
Hoxc9P09633 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC33,15■■■□□ 2,9
Hoxc9P09633 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Hoxc9P09633 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,14■■■□□ 2,9
Hoxc9P09633 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Hoxc9P09633 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33,13■■■□□ 2,89
Hoxc9P09633 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33,13■■■□□ 2,89
Hoxc9P09633 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
Hoxc9P09633 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Hoxc9P09633 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33,11■■■□□ 2,89
Hoxc9P09633 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Hoxc9P09633 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Hoxc9P09633 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
Hoxc9P09633 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC33,07■■■□□ 2,88
Hoxc9P09633 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC33,06■■■□□ 2,88
Hoxc9P09633 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,06■■■□□ 2,88
Hoxc9P09633 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Hoxc9P09633 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,05■■■□□ 2,88
Hoxc9P09633 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33,04■■■□□ 2,88
Hoxc9P09633 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC33,03■■■□□ 2,88
Hoxc9P09633 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,02■■■□□ 2,88
Hoxc9P09633 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
Hoxc9P09633 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,96■■■□□ 2,87
Hoxc9P09633 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC32,95■■■□□ 2,87
Hoxc9P09633 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,94■■■□□ 2,86
Hoxc9P09633 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Hoxc9P09633 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Hoxc9P09633 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32,93■■■□□ 2,86
Hoxc9P09633 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Hoxc9P09633 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
Hoxc9P09633 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Hoxc9P09633 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,91■■■□□ 2,86
Hoxc9P09633 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,9■■■□□ 2,86
Hoxc9P09633 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,89■■■□□ 2,86
Hoxc9P09633 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Hoxc9P09633 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,88■■■□□ 2,85
Hoxc9P09633 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32,88■■■□□ 2,85
Hoxc9P09633 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC32,87■■■□□ 2,85
Hoxc9P09633 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
Hoxc9P09633 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32,86■■■□□ 2,85
Hoxc9P09633 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Hoxc9P09633 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,85■■■□□ 2,85
Hoxc9P09633 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC32,83■■■□□ 2,85
Hoxc9P09633 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32,82■■■□□ 2,84
Hoxc9P09633 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Hoxc9P09633 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
Hoxc9P09633 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Hoxc9P09633 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
Hoxc9P09633 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32,8■■■□□ 2,84
Hoxc9P09633 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32,8■■■□□ 2,84
Hoxc9P09633 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32,79■■■□□ 2,84
Hoxc9P09633 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,78■■■□□ 2,84
Hoxc9P09633 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32,77■■■□□ 2,84
Hoxc9P09633 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,84
Hoxc9P09633 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32,74■■■□□ 2,83
Hoxc9P09633 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC32,74■■■□□ 2,83
Hoxc9P09633 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,74■■■□□ 2,83
Hoxc9P09633 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC32,72■■■□□ 2,83
Hoxc9P09633 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC32,71■■■□□ 2,83
Hoxc9P09633 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,82
Hoxc9P09633 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,69■■■□□ 2,82
Hoxc9P09633 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32,68■■■□□ 2,82
Hoxc9P09633 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,67■■■□□ 2,82
Hoxc9P09633 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC32,65■■■□□ 2,82
Hoxc9P09633 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC32,63■■■□□ 2,81
Hoxc9P09633 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC32,63■■■□□ 2,81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,4 ms