Protein–RNA interactions for Protein: P08775

Polr2a, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2aP08775 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Polr2aP08775 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Polr2aP08775 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Polr2aP08775 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Polr2aP08775 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Polr2aP08775 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Polr2aP08775 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Polr2aP08775 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Polr2aP08775 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Polr2aP08775 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Polr2aP08775 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Polr2aP08775 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Polr2aP08775 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Polr2aP08775 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Polr2aP08775 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Polr2aP08775 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Polr2aP08775 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Polr2aP08775 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Polr2aP08775 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Polr2aP08775 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Polr2aP08775 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Polr2aP08775 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Polr2aP08775 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Polr2aP08775 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Polr2aP08775 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Polr2aP08775 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Polr2aP08775 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Polr2aP08775 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Polr2aP08775 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Polr2aP08775 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Polr2aP08775 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Polr2aP08775 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Polr2aP08775 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Polr2aP08775 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Polr2aP08775 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Polr2aP08775 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Polr2aP08775 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Polr2aP08775 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Polr2aP08775 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Polr2aP08775 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Polr2aP08775 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Polr2aP08775 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Polr2aP08775 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Polr2aP08775 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Polr2aP08775 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Polr2aP08775 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Polr2aP08775 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Polr2aP08775 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Polr2aP08775 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Polr2aP08775 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Polr2aP08775 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Polr2aP08775 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Polr2aP08775 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Polr2aP08775 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Polr2aP08775 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Polr2aP08775 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Polr2aP08775 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Polr2aP08775 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Polr2aP08775 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Polr2aP08775 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Polr2aP08775 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Polr2aP08775 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Polr2aP08775 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Polr2aP08775 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Polr2aP08775 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Polr2aP08775 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Polr2aP08775 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Polr2aP08775 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Polr2aP08775 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Polr2aP08775 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Polr2aP08775 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Polr2aP08775 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Polr2aP08775 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Polr2aP08775 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Polr2aP08775 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Polr2aP08775 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Polr2aP08775 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Polr2aP08775 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Polr2aP08775 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Polr2aP08775 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Polr2aP08775 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Polr2aP08775 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Polr2aP08775 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Polr2aP08775 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr2aP08775 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Polr2aP08775 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Polr2aP08775 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Polr2aP08775 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Polr2aP08775 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Polr2aP08775 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Polr2aP08775 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Polr2aP08775 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Polr2aP08775 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Polr2aP08775 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Polr2aP08775 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Polr2aP08775 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Polr2aP08775 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Polr2aP08775 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Polr2aP08775 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC29.14■■■□□ 2.25
Polr2aP08775 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms