Protein–RNA interactions for Protein: O70583

Mid1, E3 ubiquitin-protein ligase Midline-1, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1O70583 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Mid1O70583 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mid1O70583 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Mid1O70583 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Mid1O70583 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Mid1O70583 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mid1O70583 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Mid1O70583 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mid1O70583 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Mid1O70583 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mid1O70583 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Mid1O70583 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Mid1O70583 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mid1O70583 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Mid1O70583 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mid1O70583 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mid1O70583 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Mid1O70583 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Mid1O70583 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Mid1O70583 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mid1O70583 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mid1O70583 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Mid1O70583 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mid1O70583 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Mid1O70583 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mid1O70583 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Mid1O70583 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Mid1O70583 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mid1O70583 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mid1O70583 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mid1O70583 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Mid1O70583 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Mid1O70583 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mid1O70583 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Mid1O70583 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Mid1O70583 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Mid1O70583 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Mid1O70583 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mid1O70583 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Mid1O70583 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Mid1O70583 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mid1O70583 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mid1O70583 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Mid1O70583 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Mid1O70583 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Mid1O70583 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mid1O70583 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Mid1O70583 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mid1O70583 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Mid1O70583 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mid1O70583 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Mid1O70583 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Mid1O70583 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mid1O70583 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Mid1O70583 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mid1O70583 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Mid1O70583 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Mid1O70583 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Mid1O70583 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mid1O70583 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mid1O70583 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mid1O70583 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mid1O70583 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mid1O70583 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Mid1O70583 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mid1O70583 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mid1O70583 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Mid1O70583 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mid1O70583 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mid1O70583 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mid1O70583 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mid1O70583 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mid1O70583 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mid1O70583 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mid1O70583 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mid1O70583 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mid1O70583 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mid1O70583 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mid1O70583 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mid1O70583 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mid1O70583 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Mid1O70583 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mid1O70583 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mid1O70583 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mid1O70583 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mid1O70583 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mid1O70583 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Mid1O70583 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Mid1O70583 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mid1O70583 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Mid1O70583 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mid1O70583 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mid1O70583 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mid1O70583 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mid1O70583 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mid1O70583 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mid1O70583 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mid1O70583 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mid1O70583 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Mid1O70583 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms