Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SpibO35906 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SpibO35906 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SpibO35906 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SpibO35906 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SpibO35906 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SpibO35906 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SpibO35906 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SpibO35906 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SpibO35906 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SpibO35906 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SpibO35906 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SpibO35906 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SpibO35906 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SpibO35906 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
SpibO35906 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SpibO35906 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SpibO35906 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SpibO35906 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SpibO35906 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SpibO35906 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SpibO35906 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SpibO35906 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SpibO35906 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SpibO35906 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SpibO35906 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SpibO35906 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SpibO35906 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SpibO35906 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SpibO35906 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SpibO35906 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SpibO35906 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SpibO35906 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
SpibO35906 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
SpibO35906 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SpibO35906 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SpibO35906 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SpibO35906 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SpibO35906 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SpibO35906 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SpibO35906 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SpibO35906 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SpibO35906 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SpibO35906 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SpibO35906 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SpibO35906 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
SpibO35906 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SpibO35906 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SpibO35906 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SpibO35906 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SpibO35906 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SpibO35906 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SpibO35906 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SpibO35906 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SpibO35906 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SpibO35906 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SpibO35906 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SpibO35906 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SpibO35906 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SpibO35906 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SpibO35906 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SpibO35906 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SpibO35906 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SpibO35906 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SpibO35906 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SpibO35906 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SpibO35906 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SpibO35906 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SpibO35906 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SpibO35906 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SpibO35906 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SpibO35906 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SpibO35906 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SpibO35906 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SpibO35906 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
SpibO35906 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SpibO35906 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
SpibO35906 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SpibO35906 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SpibO35906 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
SpibO35906 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SpibO35906 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SpibO35906 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SpibO35906 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SpibO35906 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SpibO35906 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SpibO35906 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SpibO35906 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SpibO35906 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
SpibO35906 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SpibO35906 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SpibO35906 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SpibO35906 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SpibO35906 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SpibO35906 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SpibO35906 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SpibO35906 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SpibO35906 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SpibO35906 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SpibO35906 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms