Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Usp17lcG5E8I7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Usp17lcG5E8I7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Usp17lcG5E8I7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Usp17lcG5E8I7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp17lcG5E8I7 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Usp17lcG5E8I7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Usp17lcG5E8I7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Usp17lcG5E8I7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp17lcG5E8I7 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Usp17lcG5E8I7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Usp17lcG5E8I7 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp17lcG5E8I7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp17lcG5E8I7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Usp17lcG5E8I7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Usp17lcG5E8I7 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Usp17lcG5E8I7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Usp17lcG5E8I7 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp17lcG5E8I7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp17lcG5E8I7 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp17lcG5E8I7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Usp17lcG5E8I7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp17lcG5E8I7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp17lcG5E8I7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp17lcG5E8I7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Usp17lcG5E8I7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp17lcG5E8I7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp17lcG5E8I7 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Usp17lcG5E8I7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Usp17lcG5E8I7 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Usp17lcG5E8I7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp17lcG5E8I7 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Usp17lcG5E8I7 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp17lcG5E8I7 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Usp17lcG5E8I7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Usp17lcG5E8I7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Usp17lcG5E8I7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Usp17lcG5E8I7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp17lcG5E8I7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp17lcG5E8I7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Usp17lcG5E8I7 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Usp17lcG5E8I7 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Usp17lcG5E8I7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Usp17lcG5E8I7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Usp17lcG5E8I7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Usp17lcG5E8I7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Usp17lcG5E8I7 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp17lcG5E8I7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp17lcG5E8I7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Usp17lcG5E8I7 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp17lcG5E8I7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp17lcG5E8I7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp17lcG5E8I7 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Usp17lcG5E8I7 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Usp17lcG5E8I7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Usp17lcG5E8I7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp17lcG5E8I7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Usp17lcG5E8I7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Usp17lcG5E8I7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Usp17lcG5E8I7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp17lcG5E8I7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Usp17lcG5E8I7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp17lcG5E8I7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp17lcG5E8I7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp17lcG5E8I7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Usp17lcG5E8I7 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp17lcG5E8I7 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Usp17lcG5E8I7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Usp17lcG5E8I7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Usp17lcG5E8I7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Usp17lcG5E8I7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Usp17lcG5E8I7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
Usp17lcG5E8I7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Usp17lcG5E8I7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Usp17lcG5E8I7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp17lcG5E8I7 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Usp17lcG5E8I7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
Usp17lcG5E8I7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Usp17lcG5E8I7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Usp17lcG5E8I7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Usp17lcG5E8I7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Usp17lcG5E8I7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Usp17lcG5E8I7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Usp17lcG5E8I7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Usp17lcG5E8I7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp17lcG5E8I7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Usp17lcG5E8I7 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp17lcG5E8I7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp17lcG5E8I7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Usp17lcG5E8I7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Usp17lcG5E8I7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Usp17lcG5E8I7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp17lcG5E8I7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Usp17lcG5E8I7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp17lcG5E8I7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Usp17lcG5E8I7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Usp17lcG5E8I7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp17lcG5E8I7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Usp17lcG5E8I7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Usp17lcG5E8I7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms