Protein–RNA interactions for Protein: F6ZGR6

D430041D05Rik, RIKEN cDNA D430041D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D430041D05RikF6ZGR6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
D430041D05RikF6ZGR6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
D430041D05RikF6ZGR6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
D430041D05RikF6ZGR6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
D430041D05RikF6ZGR6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
D430041D05RikF6ZGR6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
D430041D05RikF6ZGR6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
D430041D05RikF6ZGR6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
D430041D05RikF6ZGR6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
D430041D05RikF6ZGR6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
D430041D05RikF6ZGR6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
D430041D05RikF6ZGR6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
D430041D05RikF6ZGR6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
D430041D05RikF6ZGR6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
D430041D05RikF6ZGR6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
D430041D05RikF6ZGR6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
D430041D05RikF6ZGR6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
D430041D05RikF6ZGR6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
D430041D05RikF6ZGR6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
D430041D05RikF6ZGR6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC34.69■■■■□ 3.14
D430041D05RikF6ZGR6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
D430041D05RikF6ZGR6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
D430041D05RikF6ZGR6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
D430041D05RikF6ZGR6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
D430041D05RikF6ZGR6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.65■■■■□ 3.14
D430041D05RikF6ZGR6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
D430041D05RikF6ZGR6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
D430041D05RikF6ZGR6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
D430041D05RikF6ZGR6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
D430041D05RikF6ZGR6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
D430041D05RikF6ZGR6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
D430041D05RikF6ZGR6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
D430041D05RikF6ZGR6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
D430041D05RikF6ZGR6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
D430041D05RikF6ZGR6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
D430041D05RikF6ZGR6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
D430041D05RikF6ZGR6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
D430041D05RikF6ZGR6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
D430041D05RikF6ZGR6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
D430041D05RikF6ZGR6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
D430041D05RikF6ZGR6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
D430041D05RikF6ZGR6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
D430041D05RikF6ZGR6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
D430041D05RikF6ZGR6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
D430041D05RikF6ZGR6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
D430041D05RikF6ZGR6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
D430041D05RikF6ZGR6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
D430041D05RikF6ZGR6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
D430041D05RikF6ZGR6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
D430041D05RikF6ZGR6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
D430041D05RikF6ZGR6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
D430041D05RikF6ZGR6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
D430041D05RikF6ZGR6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
D430041D05RikF6ZGR6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
D430041D05RikF6ZGR6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
D430041D05RikF6ZGR6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
D430041D05RikF6ZGR6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
D430041D05RikF6ZGR6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
D430041D05RikF6ZGR6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
D430041D05RikF6ZGR6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
D430041D05RikF6ZGR6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
D430041D05RikF6ZGR6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
D430041D05RikF6ZGR6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
D430041D05RikF6ZGR6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
D430041D05RikF6ZGR6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
D430041D05RikF6ZGR6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
D430041D05RikF6ZGR6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
D430041D05RikF6ZGR6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
D430041D05RikF6ZGR6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
D430041D05RikF6ZGR6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
D430041D05RikF6ZGR6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
D430041D05RikF6ZGR6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
D430041D05RikF6ZGR6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
D430041D05RikF6ZGR6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
D430041D05RikF6ZGR6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
D430041D05RikF6ZGR6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
D430041D05RikF6ZGR6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
D430041D05RikF6ZGR6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
D430041D05RikF6ZGR6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
D430041D05RikF6ZGR6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
D430041D05RikF6ZGR6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
D430041D05RikF6ZGR6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
D430041D05RikF6ZGR6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
D430041D05RikF6ZGR6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
D430041D05RikF6ZGR6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
D430041D05RikF6ZGR6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
D430041D05RikF6ZGR6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
D430041D05RikF6ZGR6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
D430041D05RikF6ZGR6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
D430041D05RikF6ZGR6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
D430041D05RikF6ZGR6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
D430041D05RikF6ZGR6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
D430041D05RikF6ZGR6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
D430041D05RikF6ZGR6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
D430041D05RikF6ZGR6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
D430041D05RikF6ZGR6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.09■■■■□ 3.05
D430041D05RikF6ZGR6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
D430041D05RikF6ZGR6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
D430041D05RikF6ZGR6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms