Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Srp54bE9PXC0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Srp54bE9PXC0 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Srp54bE9PXC0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srp54bE9PXC0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srp54bE9PXC0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srp54bE9PXC0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Srp54bE9PXC0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srp54bE9PXC0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srp54bE9PXC0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Srp54bE9PXC0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srp54bE9PXC0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Srp54bE9PXC0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Srp54bE9PXC0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Srp54bE9PXC0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Srp54bE9PXC0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Srp54bE9PXC0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Srp54bE9PXC0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Srp54bE9PXC0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srp54bE9PXC0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srp54bE9PXC0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Srp54bE9PXC0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Srp54bE9PXC0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Srp54bE9PXC0 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srp54bE9PXC0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srp54bE9PXC0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Srp54bE9PXC0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srp54bE9PXC0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Srp54bE9PXC0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Srp54bE9PXC0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Srp54bE9PXC0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srp54bE9PXC0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srp54bE9PXC0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Srp54bE9PXC0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Srp54bE9PXC0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Srp54bE9PXC0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srp54bE9PXC0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Srp54bE9PXC0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Srp54bE9PXC0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srp54bE9PXC0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srp54bE9PXC0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srp54bE9PXC0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Srp54bE9PXC0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Srp54bE9PXC0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srp54bE9PXC0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srp54bE9PXC0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Srp54bE9PXC0 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Srp54bE9PXC0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Srp54bE9PXC0 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Srp54bE9PXC0 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srp54bE9PXC0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srp54bE9PXC0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Srp54bE9PXC0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Srp54bE9PXC0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Srp54bE9PXC0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Srp54bE9PXC0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Srp54bE9PXC0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srp54bE9PXC0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Srp54bE9PXC0 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srp54bE9PXC0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Srp54bE9PXC0 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srp54bE9PXC0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srp54bE9PXC0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srp54bE9PXC0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Srp54bE9PXC0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srp54bE9PXC0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srp54bE9PXC0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srp54bE9PXC0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srp54bE9PXC0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srp54bE9PXC0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srp54bE9PXC0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srp54bE9PXC0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srp54bE9PXC0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srp54bE9PXC0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srp54bE9PXC0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srp54bE9PXC0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srp54bE9PXC0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srp54bE9PXC0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srp54bE9PXC0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srp54bE9PXC0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srp54bE9PXC0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srp54bE9PXC0 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srp54bE9PXC0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srp54bE9PXC0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srp54bE9PXC0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Srp54bE9PXC0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srp54bE9PXC0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Srp54bE9PXC0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Srp54bE9PXC0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srp54bE9PXC0 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Srp54bE9PXC0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Srp54bE9PXC0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Srp54bE9PXC0 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srp54bE9PXC0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Srp54bE9PXC0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Srp54bE9PXC0 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Srp54bE9PXC0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srp54bE9PXC0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srp54bE9PXC0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Srp54bE9PXC0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms