Protein–RNA interactions for Protein: E9PVL6

Trim30b, Tripartite motif-containing 30B, mousemouse

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim30bE9PVL6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim30bE9PVL6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Trim30bE9PVL6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim30bE9PVL6 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim30bE9PVL6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Trim30bE9PVL6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Trim30bE9PVL6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim30bE9PVL6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Trim30bE9PVL6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim30bE9PVL6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim30bE9PVL6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim30bE9PVL6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim30bE9PVL6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim30bE9PVL6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim30bE9PVL6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim30bE9PVL6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim30bE9PVL6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Trim30bE9PVL6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim30bE9PVL6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Trim30bE9PVL6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Trim30bE9PVL6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim30bE9PVL6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim30bE9PVL6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Trim30bE9PVL6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim30bE9PVL6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim30bE9PVL6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Trim30bE9PVL6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim30bE9PVL6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Trim30bE9PVL6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim30bE9PVL6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Trim30bE9PVL6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim30bE9PVL6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim30bE9PVL6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim30bE9PVL6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim30bE9PVL6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim30bE9PVL6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim30bE9PVL6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim30bE9PVL6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Trim30bE9PVL6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Trim30bE9PVL6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim30bE9PVL6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim30bE9PVL6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim30bE9PVL6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Trim30bE9PVL6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim30bE9PVL6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim30bE9PVL6 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Trim30bE9PVL6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Trim30bE9PVL6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Trim30bE9PVL6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim30bE9PVL6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Trim30bE9PVL6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim30bE9PVL6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim30bE9PVL6 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Trim30bE9PVL6 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Trim30bE9PVL6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim30bE9PVL6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Trim30bE9PVL6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Trim30bE9PVL6 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Trim30bE9PVL6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Trim30bE9PVL6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim30bE9PVL6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Trim30bE9PVL6 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Trim30bE9PVL6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Trim30bE9PVL6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim30bE9PVL6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Trim30bE9PVL6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim30bE9PVL6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Trim30bE9PVL6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim30bE9PVL6 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Trim30bE9PVL6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim30bE9PVL6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim30bE9PVL6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim30bE9PVL6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim30bE9PVL6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Trim30bE9PVL6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Trim30bE9PVL6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim30bE9PVL6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Trim30bE9PVL6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim30bE9PVL6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim30bE9PVL6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim30bE9PVL6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim30bE9PVL6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim30bE9PVL6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim30bE9PVL6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim30bE9PVL6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim30bE9PVL6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim30bE9PVL6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim30bE9PVL6 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim30bE9PVL6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Trim30bE9PVL6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim30bE9PVL6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim30bE9PVL6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim30bE9PVL6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Trim30bE9PVL6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim30bE9PVL6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim30bE9PVL6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim30bE9PVL6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Trim30bE9PVL6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim30bE9PVL6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Trim30bE9PVL6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms