Protein–RNA interactions for Protein: D3YYZ2

Gm5239, MCG1031578, mousemouse

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Length 122 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5239D3YYZ2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5239D3YYZ2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5239D3YYZ2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Gm5239D3YYZ2 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gm5239D3YYZ2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5239D3YYZ2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5239D3YYZ2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gm5239D3YYZ2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm5239D3YYZ2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Gm5239D3YYZ2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm5239D3YYZ2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gm5239D3YYZ2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm5239D3YYZ2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm5239D3YYZ2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm5239D3YYZ2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm5239D3YYZ2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Gm5239D3YYZ2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm5239D3YYZ2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gm5239D3YYZ2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm5239D3YYZ2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm5239D3YYZ2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm5239D3YYZ2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm5239D3YYZ2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Gm5239D3YYZ2 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm5239D3YYZ2 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gm5239D3YYZ2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm5239D3YYZ2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gm5239D3YYZ2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gm5239D3YYZ2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm5239D3YYZ2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm5239D3YYZ2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm5239D3YYZ2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm5239D3YYZ2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gm5239D3YYZ2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5239D3YYZ2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gm5239D3YYZ2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm5239D3YYZ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm5239D3YYZ2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Gm5239D3YYZ2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm5239D3YYZ2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm5239D3YYZ2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gm5239D3YYZ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm5239D3YYZ2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm5239D3YYZ2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm5239D3YYZ2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gm5239D3YYZ2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Gm5239D3YYZ2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gm5239D3YYZ2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5239D3YYZ2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gm5239D3YYZ2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gm5239D3YYZ2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5239D3YYZ2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5239D3YYZ2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5239D3YYZ2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gm5239D3YYZ2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Gm5239D3YYZ2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5239D3YYZ2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5239D3YYZ2 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5239D3YYZ2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gm5239D3YYZ2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm5239D3YYZ2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm5239D3YYZ2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm5239D3YYZ2 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm5239D3YYZ2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm5239D3YYZ2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5239D3YYZ2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5239D3YYZ2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5239D3YYZ2 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5239D3YYZ2 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5239D3YYZ2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5239D3YYZ2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5239D3YYZ2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5239D3YYZ2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5239D3YYZ2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5239D3YYZ2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5239D3YYZ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5239D3YYZ2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5239D3YYZ2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5239D3YYZ2 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5239D3YYZ2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5239D3YYZ2 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5239D3YYZ2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5239D3YYZ2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5239D3YYZ2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5239D3YYZ2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5239D3YYZ2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5239D3YYZ2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5239D3YYZ2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5239D3YYZ2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5239D3YYZ2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5239D3YYZ2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5239D3YYZ2 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5239D3YYZ2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5239D3YYZ2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5239D3YYZ2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5239D3YYZ2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5239D3YYZ2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5239D3YYZ2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5239D3YYZ2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5239D3YYZ2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71 ms