Protein–RNA interactions for Protein: B1AT01

1700084M14Rik, RIKEN cDNA 1700084M14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700084M14RikB1AT01 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
1700084M14RikB1AT01 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
1700084M14RikB1AT01 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
1700084M14RikB1AT01 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
1700084M14RikB1AT01 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700084M14RikB1AT01 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
1700084M14RikB1AT01 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700084M14RikB1AT01 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700084M14RikB1AT01 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700084M14RikB1AT01 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
1700084M14RikB1AT01 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700084M14RikB1AT01 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
1700084M14RikB1AT01 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
1700084M14RikB1AT01 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
1700084M14RikB1AT01 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700084M14RikB1AT01 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700084M14RikB1AT01 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
1700084M14RikB1AT01 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
1700084M14RikB1AT01 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
1700084M14RikB1AT01 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700084M14RikB1AT01 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
1700084M14RikB1AT01 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
1700084M14RikB1AT01 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700084M14RikB1AT01 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700084M14RikB1AT01 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
1700084M14RikB1AT01 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
1700084M14RikB1AT01 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700084M14RikB1AT01 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
1700084M14RikB1AT01 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700084M14RikB1AT01 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700084M14RikB1AT01 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
1700084M14RikB1AT01 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
1700084M14RikB1AT01 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
1700084M14RikB1AT01 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700084M14RikB1AT01 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700084M14RikB1AT01 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
1700084M14RikB1AT01 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700084M14RikB1AT01 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700084M14RikB1AT01 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700084M14RikB1AT01 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
1700084M14RikB1AT01 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
1700084M14RikB1AT01 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700084M14RikB1AT01 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
1700084M14RikB1AT01 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700084M14RikB1AT01 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
1700084M14RikB1AT01 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700084M14RikB1AT01 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700084M14RikB1AT01 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
1700084M14RikB1AT01 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700084M14RikB1AT01 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
1700084M14RikB1AT01 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700084M14RikB1AT01 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
1700084M14RikB1AT01 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700084M14RikB1AT01 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
1700084M14RikB1AT01 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700084M14RikB1AT01 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
1700084M14RikB1AT01 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700084M14RikB1AT01 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
1700084M14RikB1AT01 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
1700084M14RikB1AT01 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
1700084M14RikB1AT01 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700084M14RikB1AT01 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700084M14RikB1AT01 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700084M14RikB1AT01 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
1700084M14RikB1AT01 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700084M14RikB1AT01 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
1700084M14RikB1AT01 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700084M14RikB1AT01 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700084M14RikB1AT01 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
1700084M14RikB1AT01 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
1700084M14RikB1AT01 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
1700084M14RikB1AT01 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
1700084M14RikB1AT01 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700084M14RikB1AT01 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700084M14RikB1AT01 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
1700084M14RikB1AT01 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700084M14RikB1AT01 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
1700084M14RikB1AT01 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
1700084M14RikB1AT01 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700084M14RikB1AT01 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700084M14RikB1AT01 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
1700084M14RikB1AT01 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700084M14RikB1AT01 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
1700084M14RikB1AT01 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700084M14RikB1AT01 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
1700084M14RikB1AT01 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
1700084M14RikB1AT01 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
1700084M14RikB1AT01 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
1700084M14RikB1AT01 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700084M14RikB1AT01 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700084M14RikB1AT01 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
1700084M14RikB1AT01 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700084M14RikB1AT01 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
1700084M14RikB1AT01 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700084M14RikB1AT01 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700084M14RikB1AT01 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
1700084M14RikB1AT01 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700084M14RikB1AT01 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
1700084M14RikB1AT01 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
1700084M14RikB1AT01 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.6 ms