Protein–RNA interactions for Protein: A2AV25

Fibcd1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fibcd1A2AV25 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Fibcd1A2AV25 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fibcd1A2AV25 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Fibcd1A2AV25 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fibcd1A2AV25 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fibcd1A2AV25 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fibcd1A2AV25 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Fibcd1A2AV25 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fibcd1A2AV25 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fibcd1A2AV25 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Fibcd1A2AV25 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Fibcd1A2AV25 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fibcd1A2AV25 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Fibcd1A2AV25 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Fibcd1A2AV25 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Fibcd1A2AV25 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Fibcd1A2AV25 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Fibcd1A2AV25 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fibcd1A2AV25 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fibcd1A2AV25 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Fibcd1A2AV25 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Fibcd1A2AV25 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Fibcd1A2AV25 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Fibcd1A2AV25 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Fibcd1A2AV25 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fibcd1A2AV25 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Fibcd1A2AV25 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fibcd1A2AV25 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fibcd1A2AV25 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Fibcd1A2AV25 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fibcd1A2AV25 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Fibcd1A2AV25 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Fibcd1A2AV25 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fibcd1A2AV25 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Fibcd1A2AV25 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Fibcd1A2AV25 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Fibcd1A2AV25 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Fibcd1A2AV25 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Fibcd1A2AV25 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fibcd1A2AV25 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Fibcd1A2AV25 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fibcd1A2AV25 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Fibcd1A2AV25 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fibcd1A2AV25 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fibcd1A2AV25 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fibcd1A2AV25 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fibcd1A2AV25 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fibcd1A2AV25 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fibcd1A2AV25 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fibcd1A2AV25 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fibcd1A2AV25 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fibcd1A2AV25 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fibcd1A2AV25 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Fibcd1A2AV25 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fibcd1A2AV25 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fibcd1A2AV25 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fibcd1A2AV25 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fibcd1A2AV25 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fibcd1A2AV25 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fibcd1A2AV25 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fibcd1A2AV25 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fibcd1A2AV25 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Fibcd1A2AV25 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fibcd1A2AV25 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Fibcd1A2AV25 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Fibcd1A2AV25 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fibcd1A2AV25 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fibcd1A2AV25 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fibcd1A2AV25 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Fibcd1A2AV25 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Fibcd1A2AV25 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fibcd1A2AV25 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Fibcd1A2AV25 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fibcd1A2AV25 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Fibcd1A2AV25 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Fibcd1A2AV25 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fibcd1A2AV25 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fibcd1A2AV25 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Fibcd1A2AV25 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Fibcd1A2AV25 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fibcd1A2AV25 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fibcd1A2AV25 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Fibcd1A2AV25 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Fibcd1A2AV25 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fibcd1A2AV25 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fibcd1A2AV25 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Fibcd1A2AV25 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Fibcd1A2AV25 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fibcd1A2AV25 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Fibcd1A2AV25 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fibcd1A2AV25 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Fibcd1A2AV25 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fibcd1A2AV25 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Fibcd1A2AV25 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fibcd1A2AV25 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fibcd1A2AV25 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fibcd1A2AV25 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fibcd1A2AV25 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fibcd1A2AV25 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Fibcd1A2AV25 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms