Protein–RNA interactions for Protein: A2AMD2

Ankrd60, Ankyrin repeat domain 60, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd60A2AMD2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ankrd60A2AMD2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd60A2AMD2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ankrd60A2AMD2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd60A2AMD2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ankrd60A2AMD2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ankrd60A2AMD2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd60A2AMD2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd60A2AMD2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ankrd60A2AMD2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Ankrd60A2AMD2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd60A2AMD2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ankrd60A2AMD2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd60A2AMD2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd60A2AMD2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ankrd60A2AMD2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd60A2AMD2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd60A2AMD2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd60A2AMD2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd60A2AMD2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ankrd60A2AMD2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd60A2AMD2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd60A2AMD2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ankrd60A2AMD2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd60A2AMD2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd60A2AMD2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ankrd60A2AMD2 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ankrd60A2AMD2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd60A2AMD2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd60A2AMD2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ankrd60A2AMD2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd60A2AMD2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd60A2AMD2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ankrd60A2AMD2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd60A2AMD2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ankrd60A2AMD2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd60A2AMD2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ankrd60A2AMD2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd60A2AMD2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd60A2AMD2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd60A2AMD2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ankrd60A2AMD2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ankrd60A2AMD2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd60A2AMD2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd60A2AMD2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ankrd60A2AMD2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd60A2AMD2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ankrd60A2AMD2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd60A2AMD2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ankrd60A2AMD2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd60A2AMD2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd60A2AMD2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd60A2AMD2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd60A2AMD2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd60A2AMD2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd60A2AMD2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd60A2AMD2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ankrd60A2AMD2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd60A2AMD2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ankrd60A2AMD2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ankrd60A2AMD2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd60A2AMD2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd60A2AMD2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ankrd60A2AMD2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd60A2AMD2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ankrd60A2AMD2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ankrd60A2AMD2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd60A2AMD2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd60A2AMD2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ankrd60A2AMD2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd60A2AMD2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd60A2AMD2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Ankrd60A2AMD2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd60A2AMD2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd60A2AMD2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Ankrd60A2AMD2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Ankrd60A2AMD2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd60A2AMD2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd60A2AMD2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Ankrd60A2AMD2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd60A2AMD2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd60A2AMD2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd60A2AMD2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd60A2AMD2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Ankrd60A2AMD2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd60A2AMD2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd60A2AMD2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd60A2AMD2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Ankrd60A2AMD2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd60A2AMD2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Ankrd60A2AMD2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ankrd60A2AMD2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Ankrd60A2AMD2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd60A2AMD2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd60A2AMD2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd60A2AMD2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd60A2AMD2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Ankrd60A2AMD2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd60A2AMD2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Ankrd60A2AMD2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 177.5 ms