Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fbxo47A2A6H3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Fbxo47A2A6H3 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Fbxo47A2A6H3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Fbxo47A2A6H3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Fbxo47A2A6H3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fbxo47A2A6H3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Fbxo47A2A6H3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fbxo47A2A6H3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Fbxo47A2A6H3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Fbxo47A2A6H3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fbxo47A2A6H3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Fbxo47A2A6H3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Fbxo47A2A6H3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Fbxo47A2A6H3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fbxo47A2A6H3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fbxo47A2A6H3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fbxo47A2A6H3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Fbxo47A2A6H3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fbxo47A2A6H3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fbxo47A2A6H3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fbxo47A2A6H3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fbxo47A2A6H3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fbxo47A2A6H3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Fbxo47A2A6H3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fbxo47A2A6H3 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbxo47A2A6H3 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbxo47A2A6H3 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fbxo47A2A6H3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fbxo47A2A6H3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fbxo47A2A6H3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fbxo47A2A6H3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Fbxo47A2A6H3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbxo47A2A6H3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbxo47A2A6H3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fbxo47A2A6H3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Fbxo47A2A6H3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Fbxo47A2A6H3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Fbxo47A2A6H3 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fbxo47A2A6H3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fbxo47A2A6H3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Fbxo47A2A6H3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fbxo47A2A6H3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fbxo47A2A6H3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fbxo47A2A6H3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Fbxo47A2A6H3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxo47A2A6H3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxo47A2A6H3 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxo47A2A6H3 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxo47A2A6H3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxo47A2A6H3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Fbxo47A2A6H3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxo47A2A6H3 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxo47A2A6H3 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxo47A2A6H3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Fbxo47A2A6H3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Fbxo47A2A6H3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Fbxo47A2A6H3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fbxo47A2A6H3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fbxo47A2A6H3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Fbxo47A2A6H3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbxo47A2A6H3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbxo47A2A6H3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Fbxo47A2A6H3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Fbxo47A2A6H3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxo47A2A6H3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Fbxo47A2A6H3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbxo47A2A6H3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Fbxo47A2A6H3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fbxo47A2A6H3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fbxo47A2A6H3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fbxo47A2A6H3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo47A2A6H3 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo47A2A6H3 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo47A2A6H3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Fbxo47A2A6H3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo47A2A6H3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fbxo47A2A6H3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo47A2A6H3 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo47A2A6H3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo47A2A6H3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fbxo47A2A6H3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbxo47A2A6H3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fbxo47A2A6H3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxo47A2A6H3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fbxo47A2A6H3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbxo47A2A6H3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fbxo47A2A6H3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fbxo47A2A6H3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Fbxo47A2A6H3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fbxo47A2A6H3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fbxo47A2A6H3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo47A2A6H3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo47A2A6H3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo47A2A6H3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo47A2A6H3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Fbxo47A2A6H3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Fbxo47A2A6H3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Fbxo47A2A6H3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Fbxo47A2A6H3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms