Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ7

Larp1b, La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Fragment), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Larp1bA0A0A6YXJ7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Larp1bA0A0A6YXJ7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Larp1bA0A0A6YXJ7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Larp1bA0A0A6YXJ7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Larp1bA0A0A6YXJ7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Larp1bA0A0A6YXJ7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Larp1bA0A0A6YXJ7 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Larp1bA0A0A6YXJ7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
Larp1bA0A0A6YXJ7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Larp1bA0A0A6YXJ7 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Larp1bA0A0A6YXJ7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Larp1bA0A0A6YXJ7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Larp1bA0A0A6YXJ7 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
Larp1bA0A0A6YXJ7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Larp1bA0A0A6YXJ7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Larp1bA0A0A6YXJ7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
Larp1bA0A0A6YXJ7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
Larp1bA0A0A6YXJ7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
Larp1bA0A0A6YXJ7 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
Larp1bA0A0A6YXJ7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Larp1bA0A0A6YXJ7 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Larp1bA0A0A6YXJ7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Larp1bA0A0A6YXJ7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Larp1bA0A0A6YXJ7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Larp1bA0A0A6YXJ7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Larp1bA0A0A6YXJ7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Larp1bA0A0A6YXJ7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC32.19■■■□□ 2.74
Larp1bA0A0A6YXJ7 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
Larp1bA0A0A6YXJ7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
Larp1bA0A0A6YXJ7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC32.14■■■□□ 2.74
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
Larp1bA0A0A6YXJ7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Larp1bA0A0A6YXJ7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
Larp1bA0A0A6YXJ7 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms