Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F1

PARP3, Poly [ADP-ribose] polymerase 3, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP3Q9Y6F1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
PARP3Q9Y6F1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
PARP3Q9Y6F1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms