Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TRAPPC1Q9Y5R8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms