Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5M8

SRPRB, Signal recognition particle receptor subunit beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPRBQ9Y5M8 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPRBQ9Y5M8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPRBQ9Y5M8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPRBQ9Y5M8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPRBQ9Y5M8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPRBQ9Y5M8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPRBQ9Y5M8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPRBQ9Y5M8 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SRPRBQ9Y5M8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPRBQ9Y5M8 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPRBQ9Y5M8 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPRBQ9Y5M8 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPRBQ9Y5M8 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SRPRBQ9Y5M8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SRPRBQ9Y5M8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRPRBQ9Y5M8 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
SRPRBQ9Y5M8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRPRBQ9Y5M8 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRPRBQ9Y5M8 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRPRBQ9Y5M8 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SRPRBQ9Y5M8 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms