Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF330Q9Y3S2 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF330Q9Y3S2 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF330Q9Y3S2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF330Q9Y3S2 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF330Q9Y3S2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF330Q9Y3S2 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF330Q9Y3S2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF330Q9Y3S2 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF330Q9Y3S2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF330Q9Y3S2 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF330Q9Y3S2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF330Q9Y3S2 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF330Q9Y3S2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF330Q9Y3S2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF330Q9Y3S2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ZNF330Q9Y3S2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.88
ZNF330Q9Y3S2 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF330Q9Y3S2 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms