Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
KCNIP3Q9Y2W7 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms