Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W1

THRAP3, Thyroid hormone receptor-associated protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 955 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THRAP3Q9Y2W1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.77■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
THRAP3Q9Y2W1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
THRAP3Q9Y2W1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms