Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T7

YBX2, Y-box-binding protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YBX2Q9Y2T7 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YBX2Q9Y2T7 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
YBX2Q9Y2T7 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YBX2Q9Y2T7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YBX2Q9Y2T7 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YBX2Q9Y2T7 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YBX2Q9Y2T7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YBX2Q9Y2T7 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YBX2Q9Y2T7 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YBX2Q9Y2T7 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
YBX2Q9Y2T7 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
YBX2Q9Y2T7 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
YBX2Q9Y2T7 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
YBX2Q9Y2T7 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms