Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y275

TNFSF13B, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF13BQ9Y275 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF13BQ9Y275 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF13BQ9Y275 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF13BQ9Y275 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TNFSF13BQ9Y275 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFSF13BQ9Y275 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFSF13BQ9Y275 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFSF13BQ9Y275 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TNFSF13BQ9Y275 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TNFSF13BQ9Y275 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TNFSF13BQ9Y275 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms