Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HPS5Q9UPZ3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HPS5Q9UPZ3 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms