Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TTF2Q9UNY4 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TTF2Q9UNY4 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms