Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN81

L1RE1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1RE1Q9UN81 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
L1RE1Q9UN81 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
L1RE1Q9UN81 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms