Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKK3

PARP4, Poly [ADP-ribose] polymerase 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP4Q9UKK3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PARP4Q9UKK3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PARP4Q9UKK3 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PARP4Q9UKK3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms