Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ83

HACL1, 2-hydroxyacyl-CoA lyase 1, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACL1Q9UJ83 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACL1Q9UJ83 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACL1Q9UJ83 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACL1Q9UJ83 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACL1Q9UJ83 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACL1Q9UJ83 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACL1Q9UJ83 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACL1Q9UJ83 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACL1Q9UJ83 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACL1Q9UJ83 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACL1Q9UJ83 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
HACL1Q9UJ83 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HACL1Q9UJ83 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HACL1Q9UJ83 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HACL1Q9UJ83 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
HACL1Q9UJ83 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HACL1Q9UJ83 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HACL1Q9UJ83 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
HACL1Q9UJ83 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HACL1Q9UJ83 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HACL1Q9UJ83 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms