Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RABGEF1Q9UJ41 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
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