Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU9

NXF1, Nuclear RNA export factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF1Q9UBU9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NXF1Q9UBU9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
NXF1Q9UBU9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms