Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
SPASTQ9UBP0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
SPASTQ9UBP0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms