Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ARHGAP28Q9P2N2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms