Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
KLHL42Q9P2K6 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
KLHL42Q9P2K6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms