Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0S2

COX16, Cytochrome c oxidase assembly protein COX16 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX16Q9P0S2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
COX16Q9P0S2 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
COX16Q9P0S2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms