Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NKIRAS1Q9NYS0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NKIRAS1Q9NYS0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms