Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM248Q9NWD8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM248Q9NWD8 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms