Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV12

TMEM140, Transmembrane protein 140, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM140Q9NV12 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM140Q9NV12 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms