Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GINM1Q9NU53 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GINM1Q9NU53 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms