Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SALL1Q9NSC2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SALL1Q9NSC2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms