Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA2

KCND1, Potassium voltage-gated channel subfamily D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCND1Q9NSA2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KCND1Q9NSA2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCND1Q9NSA2 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms