Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SH2B1Q9NRF2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SH2B1Q9NRF2 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms