Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
FAM60AQ9NP50 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
FAM60AQ9NP50 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms