Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
ELL3Q9HB65 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ELL3Q9HB65 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms